Servicios, cursos y colaboraciones

Servicios

Analizamos datos procedentes de cualquier tecnología genómica (Ej: microarrays, secuenciación masiva), proteómica y trascriptómica (RNASeq).

1. Análisis de la calidad de las secuencias

2. Alineamiento de secuencias sobre un genoma de referencia

3. Ensamble de genomas guiados por referencia

4. Análisis de expresión diferencial

5. Predicción y anotación de genes

6. Anotación de transcritos

7. Búsquedas en las bases de datos

Contamos con 2 servidores virtuales para la ejecución de análisis bioinformáticos y tienen las siguientes características:

Servidor virtual Biocluster, 40 cores de procesamiento, 126GB de memoria RAM, almacenamiento de 7TB.

Servidor virtual Honjo, 12 cores de procesamiento, 32 GB de memoria RAM, almacenamiento de 1TB

Instituto Nacional de Salud Pública INSP

Ponente: "Análisis de datos en ciencias genómicas usando R."

IBT-UNAM

Ponente: "Introducción amplicones 16S, ecología microbiana y Análisis de secuencias de amplicones."

Ponente: "Herramientas Bioinformáticas para el análisis de datos de secuenciación masiva de ADN.”

Profesor adjunto - INSP

“Curso básico de Bioinformática y Proteómica”.